Orta Vadeli Plan'da (2016-2018) genel bütçe kapsamındaki kamu idareleri ile özel bütçeli idarelerin 2016 yılı bütçe ödenek teklif tavanlarına da yer verildi. Bütçe ödeneklerinde en fazla pay ayrılan ilk 3 idare, bu yıl da değişmedi. Buna göre, çeşitli kamu kuruluşlarının bütçe açıklarının finansmanına dönük transfer ödeneği de buradan karşılandığı için Maliye Bakanlığı'na 131 milyar 177 milyon 156 bin 500 lira ödenek ayrıldı. Milli Eğitim, 74 milyar 419 milyon 306 bin lira ödenekle ikinci sırada yer alırken, faiz ödemeleri nedeniyle Hazine Müsteşarlığı'nın da bütçesi yüksek tutularak 70 milyar 811 milyon 308 bin lira olarak belirlendi.